1950–1957 m. mokėsi Subačiaus (Kupiškio r.) vidurinėje mokykloje, 1957–1961 m. – Subačiaus geležinkelio stoties (Kupiškio r.) vidurinėje mokykloje. 1961–1969 m. su petrauka studijavo Lietuvos veterinarijos akademijoje, įgijo zootechniko išsilavinimą.

Pertraukęs studijas, 1963–1966 m. jis atliko privalomąją karinę tarnybą sovietinėje kariuomenėje.

1969–1970 m. P. Keburys dirbo Zarasų paukštininkystės tarybiniame ūkyje vyriausiuoju zootechniku, 1970–1971 m. buvo Kupiškio žemės ūkio valdybos vyriausiasis zootechnikas.

1971–1972 m. jis dirbo Panevėžio valstybinės veislininkystės stoties vyriausiuoju zootechniku, 1972–1976 m. buvo šios stoties direktorius. 1976–1988 m. P. Keburys buvo Pasvalio tarprajoninės veislininkystės įmonės Panevėžio filialo vedėjas, 1988–1994 m. –  Panevėžio kooperatinės valstybinės veislininkystės įmonės direktorius, 1994–1995 m. – Panevėžio valstybinio veislinių buliukų auginimo ūkio direktorius.

Darbo reikalais jis lankėsi Vokietijoje: pirko veislinių telyčių bei buliukų (1986 m.), susipažino su Šlezvigo-Holšteino (Schleswig-Holstein) žemės galvijų selekcininkų darbu (1990 m.).

1995–2013 m. P. Keburys buvo uždarosios akcinės bendrovės "Panevėžio veislininkystė" (veislinių jaučių auginimas) direktorius, kol išėjo į pensiją.

Jis buvo Lietuvos žalųjų galvijų gerinimo tarybos narys.

Už ilgametį darbą veislininkystės srityje jis buvo apdovanotas Lietuvos žemės ūkio ministerijos garbės raštu (2013 m.).

Laisvalaikiu dirbo sode, grybaudavo, žvejodavo.

Buvo vedęs, žmona Birutė Keburienė (g. 1948 m.) – biologė.

Mirė 2018 m. birželio 23 d. Palaidotas Garliavos (Jonučių) kapinėse (21 kvartalas, 2 eilė, 5 kapavietė). Kapč ženklina pilkai rusvo šlifuoto akmens paminklinė kompozicija, steloje – įrašas metalinėmis raidėmis: "Keburiai / Petras 1942–2018".