1962-1973 m. mokėsi Utenos T. Tilvyčio vidurinėje mokykloje. 1973-1979 m. studijavo Lietuvos veterinarijos akademijoje, 1980-1982 m. – Lietuvos kūno kultūros institute.

1982-1992 m. V. Trinkūnas dirbo Klaipėdos mėsos kombinate veterinarijos gydytoju, kadrų skyriaus viršininku, generaliniu direktoriumi.

1992-1994 m. jis buvo Lietuvos ir Vokietijos bendrosios įmonės "Dukatas" direktorius, 1993 m. – valstybinės žvejybos laivyno įmonės "Jūra" generalinis direktorius, 1994-1999 m. – akcinės bendrovės "Kretingos grūdai" generalinis direktorius.

V. Trinkūnas buvo akcinės bendrovės "Kretingos grūdai" (1994-2006 m.), akcinės bendrovės "Rokiškio grūdai", akcinės bendrovės "Vilniaus grūdai" valdybos pirmininkas, Lietuvos grūdų perdirbėjų asociacijos prezidentas, Klaipėdos prekybos, pramonės ir amatų rūmų tarybos narys.

1999-2005 m. jis buvo bendrovės "Odivita" generalinis direktorius.

Nuo 2005 m. iki šiol V. Trinkūnas yra bendrovės "Raminora" (Druskininkų sanatorija "SPA Vilnius Sana") valdybos pirmininkas, 2005-2007 m. buvo ir šios bendrovės direktorius.

Nuo 2006 m. V. Trinkūnas yra ir uždarosios akcinės bendrovės "Anšilas", statančios Anykščiuose SPA centrą, valdybos pirmininkas.

V. Trinkūnas yra Druskininkų kurorto sveikatinimo įstaigų asociacijos prezidentas, Druskininkų Rotary klubo narys.

Jaunystėje V. Trinkūnas buvo sportininkas rankininkas. 1974-1982 m. jis buvo Lietuvos rankinio jaunimo rinktinės, Kauno "Granito" ir Lietuvos vyrų rankinio rinktinės narys, TSRS čempionatų ir Tautų spartakiadų prizininkas.

V. Trinkūnui buvo suteiktas TSRS sporto meistro vardas.

Laisvalaikiu sportuoja, medžioja.

Žmona Dalė. Dukterys: Dovilė (g. 1981 m.), Ieva (g. 1987 m.).