1961 m. baigė Rokiškio vidurinę mokyklą. 1961–1967 m. studijavo Kauno politechnikos instituto Cheminės technologijos fakultete, įgijo chemiko technologo išsilavinimą.

1961–1963 m. B. Pajarskas dirbo Kauno vilnos audinių fabrike "Liteksas" karbonizatoriumi.

1966–1986 m. jis buvo Kauno dirbtinio pluošto gamyklos Verpimo cecho technikas, pamainos meistras, filjerinės meistras, technologas, Centrinės laboratorijos vyriausiasis inžinierius, sektoriaus viršininkas, gamyklos vyriausiasis technologas.

1979 m. Kauno politechnikos institute B. Pajarskas apsigynė kandidatinę disertaciją "Acetilceliuliozinių tekstilinių medžiagų su permanentinėmis antistatinėmis savybėmis gavimo būdų tyrimai", 1993 m. nostrifikuotas technologijos mokslų, chemijos inžinerijos daktaras.

1986–1990 m. jis dirbo Kauno dirbtinio pluošto gamyklos valstybinio priėmimo vadovu, 1990–1992 m. – vyriausiojo inžinieriaus pavaduotoju, direktoriaus pavaduotoju, direktoriumi progresui.

1992–1993 m. B. Pajarskas buvo akcinės bendrovės "Linoteksas" direktorius. 1993–2001 m. jis buvo Lietuvos ir Austrijos bendrosios įmonės uždarosios akcinės bendrovės "Kateks" direktorius, kol ši įmonė bankrutavo ir buvo likviduota.

B. Pajarsko mokslinių tyrimų sritis – cheminių medžiagų antistatikų gavimo būdas ir jų naudojimas verpimo tirpale, suformuojant acetatinius siūlus, įgaunančius permanentines antistatines savybes. Jis yra 6 išradimų autorius.

Laisvalaikiu medžioja, žvejoja.

Vedęs, žmona Irena Pajarskienė – gydytoja.