Tėvai: Česlovas Gudauskas (g. 1940 m.) – pedagogas ir Natalija Gudauskienė (g. 1935 m.) – pedagogė chemijos mokytoja, mokyklos vadovė.

1995 m. baigė Lyduokių (Ukmergės r.) vidurinę mokyklą. Tuo pačiu metu mokėsi Ukmergės muzikos mokykloje, grojo moksleivių grupėje klavišiniais instrumentais. 1995–2001 m. studijavo Kauno technologijos universitete, įgijo verslo administravimo bakalauro ir vadybos magistro išsilavinimą.

2001–2005 m. M. Gudauskas dirbo Vilniaus įmonėje "Kappa Packaging Baltic" (pakavimo ir fasavimo įranga, medžiagos) gamybos vadovu.

2005–2008 m. jis gyveno Anykščiuose ir buvo akcinės bendrovės "Anykščių vynas" generalinis direktorius – pirmasis baigtos privatizuoti įmonės vadovas. Jam vadovaujant, bendrovė vėl pradėjo gauti pelno, jo iniciatyva buvo plėtojama vyndarystė kaip garbingas ir istoriškas Anykščių krašto verslas, tęsiama vyno švenčių tradicija.

Nuo 2008 m. M. Gudauskas gyvena ir dirba Vilniuje.

2008–2009 m. jis buvo uždarosios akcinės bendrovės "Elmenhorster Vilnius" (natūralių sulčių gamyba) generalinis direktorius. Šiai įmonei pakeitus pavadinimą, 2009–2022 m. jis dirbo uždarosios akcinės bendrovės "Eckes-Granini Lietuva" generaliniu direktoriumi.

Pertvarkius šią įmonę, nuo 2022 m. M. Gudauskas yra uždarosios akcinės bendrovės "Eckes-Granini Baltic" generalinis direktorius, vadovauja didžiausiai Lietuvoje vaisių, uogų ir daržovių sulčių gamybos įmonei.

Jis apdovanotas padėka už Utenos apskrities kultūros rėmimą (2007 m.). 

Vedė 2000 m., žmona Edita Rudokaitė-Gudauskienė (g. 1976 m.) – vadybininkė. Vaikai: Jonas Gudauskas (g. 2006 m.), Ieva Gudauskaitė (g. 2013 m.).