Mokėsi Antaplaštakio (Anykščių r.) ir Avižienių pradinėse mokyklose, baigė Ukmergės 1-ąją vidurinę mokyklą. Studijavo Lietuvos veterinarijos akademijoje, 1962 m. baigė Vilniaus pedagoginį institutą, įgijo geografijos ir biologijos mokytojo išsilavinimą.

1962–2002 m. S. A. Misiūnas dirbo Žemaitkiemio (Ukmergės r.) aštuonmetėje, pagrindinėje mokykloje.

1962–1967 m. jis buvo šios mokyklos mokytojas, 1967–2002 m. – Žemaitkiemio mokyklos direktorius. 1967–1988 m. jis vadovavo aštuonmetei, 1988–1993 m. – devynmetei, 1993–2002 m. – pagrindinei mokyklai, kol išėjo į pensiją.

Dabar S. A. Misiūnas yra ūkininkas.

2003 m. S. A. Misiūnas subūrė Ukmergės rajono Žemaitkiemio miestelio bendruomenę ir 2003–2005 m. buvo pirmasis jos pirmininkas. Dabar jis yra Žemaitkiemio bendruomenės narys, aktyviai dalyvauja jos veikloje.

Vedęs, žmona Alfonsa Misiūnienė – medikė.