Tėvai: Viktoras Giedraitis (1898–1977) ir Marijona Tauginaitė-Giedraitienė (1894–1981) iš Mileikiškių – žemdirbiai ūkininkai. Augo šešių vaikų šeimoje, buvo jauniausia. Broliai ir seserys: Alfonsas Giedraitis (1925–2007) – agronomas, žemės ūkio veiklos organizatorius, vadovas, politikas, Albertas Giedraitis (1926–2004) – tremtinys, vairuotojas, Vanda Giedraitytė-Žarskienė (g. 1928 m.) – mezgėja, Antanas Giedraitis (1929–1967) – mechanikas ir Adolfas Giedraitis (g. 1930 m.) – mechanikas.

1949 m. ištrėmus tėvą ir brolį Albertą į Sibirą (Rusija), likę šeimos nariai slapstėsi Anykščių ir Panevėžio rajonuose.

1947 m. baigė Andrioniškio (Anykščių r.) pradinę mokyklą, 1954 m. – Panevėžio 4-ąją vidurinę mokyklą. 1960 m. Kauno sodininkystės-daržininkystės technikume ji įgijo agronomės specialybę.

1960–1977 m. S. Kaupienė dirbo Šlapaberžės (Kėdainių r.) mechanizacijos mokyklos mokomajame ūkyje, buvo vedėja-agronomė. Ji su šeima gyveno Panevėžyje, vėliau įsikūrė ir pasiliko Ėriškiuose (Panevėžio r.).

1977–1990 m. ji buvo Panevėžio rajono Ramygalos apylinkės Vykdomojo komiteto pirmininkė, 1990–1995 m. toliau dirbo Ramygalos apylinkės viršaite, kol išėjo į pensiją.

Lietuvos Atgimimo metais S. Kaupienė dalyvavo kuriant Lietuvos Persitvarkymo Sąjūdžio Ramygalos iniciatyvinę grupę, buvo Lietuvos Persitvarkymo Sąjūdžio Seimo nario, SSRS Liaudies deputatų suvažiavimo deputato Virmanto Velikonio patikėtinė jo rinkiminėje kampanijoje.

Ištekėjo 1959 m., vyras Stasys Kaupas (1926–2016) – pedagogas, nuo 1951 m. politinis kalinys Leningrado (Rusija) Kronštadto kalėjime ir Kemerovo srities bei Omsko (Rusija) lageriuose. Vaikai: Almantas Kaupas (1962–2012) – verslininkas, Auksė Kaupaitė-Kanišauskienė (g. 1967 m.) – inžinierė technologė ir Audronius Kaupas (g. 1960 m.)  – inžinierius.