Baigė Žemaičių vyskupijos kunigų seminariją Kaune.

1887 m. A. Petraitis buvo įšventintas kunigu.

1887–1898 m. jis tarnavo vikaru Šaukėnuose (Kelmės r.), Papilėje (Akmenės r.) ir kitur.

Atvykęs 1898 m. lapkritį, 1898–1902 m. jis buvo Skaudvilės (Tauragės r.) parapijos vikaras.

Paskirtas 1902 m. sausį, 1902–1904 m. A. Petraitis beveik trejus metus tarnavo Debeikių (Anykščių r.) parapijoje vikaru, talkino klebonui Povilui Šimkevičiui, kol 1904 m. lapkritį parapiją paliko.

Visur caro valdžios jis buvo vertinamas kaip nepatikimas asmuo, todėl 1905 m. išvyko į JAV. Įsikūręs Čikagoje (Ilinojaus valstija), 1905–1930 m. A. Petraitis tarnavo Čikagos  lietuvių Šv. Juozapo parapijos, įsteigtos 1900 m., klebonu, įkūrė fondą Lietuvai remti. Parapija telkė pietiniuose Čikagos rajonuose XX a. pirmojoje pusėje gyvenusius lietuvius katalikus.

A. Petraitis domėjosi astronomija, buvo nusipirkęs teleskopą, įsirengęs savo observatoriją, kurią pavadino "Kun. A. Petraiczio zvaigzdiu teminyce". Jis laikomas vienu pirmųjų lietuvių astronomijos praktikų. JAV lietuvių spaudoje jis paskelbė straipsnių su nuotraukomis apie astronominius objektus. Tyrinėti dangaus kūnus pas jį rinkdavosi Ilinojaus valstijoje studijavę studentai. Parapijoje jis įkūrė žvėryną, kuris buvo populiarus tarp Čikagos lietuvių.

1925 m. per agentus varžytynėse jis nusipirko Zamkaus dvarą (Pilies I k., Jurbarko r.), ten planuodamas senatvėje perkelti iš JAV savo observatoriją.

1930 m. pasitraukęs iš parapijos ir grįždamas į Lietuvą, jis neįstengė sumokėti muito mokesčio už išvežamą įrangą, todėl teleskopą pardavė ir paliko Amerikoje.

Rūpindamasis jaunimo švietimu, A. Petraitis pakvietė vienuolius iš Italijos ir 1930 m. parašytu testamentu padovanojo jiems dvarą saleziečių centrui įkurti. Jo iniciatyva po jo mirties 1934 m. į Lietuvą atvykę vienuoliai Zamkaus dvare įsteigė Vytėnų saleziečių namus – pirmąją Lietuvoje šios vienuolijos veiklos centrą.

Mirė 1933 m. sausio 25 d. Skirsnemunėje (Jurbarko r.). Buvo palaidotas Skirsnemunės Šv. Jurgio bažnyčios šventoriuje.

1937 m. jo palaikai buvo perlaidoti dvaro teritorijoje prie Vytėnų saleziečių namų, įrengus laidojimo koplyčią. Antrojo pasaulinio karo metais palaikai dar kartą buvo perlaidoti Skirsnemunės bažnyčios požemio kriptoje.

Skirsnemunės Šv. Jurgio bažnyčioje jam atidengta atminimo lenta (2005 m.). Mecenatas A. Petraitis minimas ir prie buvusios Vytėnų saleziečių namų koplyčios įrengtoje memorialinėje lentoje.

Vytėnų (Jurbarko r.) pagrindinėje mokykloje buvo įrengta ir iki 2013 m., kol mokykla buvo uždaryta, veikė ekspozicija apie kunigo A. Petraičio gyvenimą.

Išleista knyga apie kun. A. Petraitį "Gyvenimo tikslas" (sudarė Petra Petraitienė, 2007 m.).