Nuo 1962 m. mokėsi Tauragnų (Utenos r.) vidurinėje mokykloje. Tėvams persikėlus, augo Utenoje, 1973 m. baigė Utenos T. Tilvyčio vidurinę mokyklą. 1973–1979 m. studijavo Lietuvos veterinarijos akademijoje, įgijo veterinarijos gydytojo išsilavinimą. 1980–1982 m. toliau studijavo Lietuvos kūno kultūros institute.

1982–1986 m. V. Trinkūnas dirbo Klaipėdos mėsos kombinate veterinarijos gydytoju, personalo skyriaus viršininku, 1986–1992 m. buvo šios įmonės generalinis direktorius. Kiek laiko jis ėjo Lietuvos mėsos perdirbėjų asociacijos prezidento pareigas.

Išėjęs į privatų verslą, 1992–1994 m. jis buvo Lietuvos ir Vokietijos bendrosios įmonės "Dukatas" (eksportas ir importas) direktorius. 1993 m. pusmetį jis dirbo valstybinės žvejybos laivyno įmonės "Jūra" generaliniu direktoriumi, kol šių pareigų atsisakė. 1994–1999 m. jis buvo akcinės bendrovės "Kretingos grūdai" generalinis direktorius.

V. Trinkūnas buvo akcinės bendrovės "Kretingos grūdai" (1994–2006 m.), akcinės bendrovės "Rokiškio grūdai", akcinės bendrovės "Vilniaus grūdai" valdybos pirmininkas, Lietuvos grūdų perdirbėjų asociacijos prezidentas, Klaipėdos prekybos, pramonės ir amatų rūmų tarybos narys.

1999–2005 m. jis buvo bendrovės "Odivita" generalinis direktorius.

Nuo 2005 m. iki šiol V. Trinkūnas yra bendrovės "Raminora" (Druskininkų sanatorija "SPA Vilnius Sana") valdybos pirmininkas, 2005–2007 m. buvo ir šios bendrovės direktorius. Ši įmonė 2008 m. atidarė ir dienos SPA centrą Vilniuje.

Nuo 2006 m. V. Trinkūnas yra ir uždarosios akcinės bendrovės "Anšilas", pastačiusios ir eksploatuojančios Anykščiuose pirmąjį SPA centrą, valdybos pirmininkas. Jo iniciatyva 2014 m. Anykščių pietvakariniame pakraštyje pastatytas ir įrengtas poilsio ir sveikatingumo kompleksas "SPA Vilnius Anykščiai" – 120 vietų keturių žvaigždučių viešbutis su SPA paslaugų ir maitinimo infrastruktūra, sukurta 80 darbo vietų.

Bendrovei "Anšilas" nuo 2017 m. priklauso ir kontrolinis uždarosios akcinės bendrovės "Atvirai" akcijų paketas, taip ji valdo Anykščių žiniasklaidos grupę "Nykščiai" – radijo stotį ir interneto portalą.

V. Trinkūnas yra Druskininkų kurorto sveikatinimo įstaigų asociacijos prezidentas, Nacionalinės SPA asociacijos tarybos narys. Nuo 1993 m. jis dalyvauja "Rotary" klubų veikloje, buvo Klaipėdos "Rotary" klubo prezidentas, iki 2016 m. – Druskininkų "Rotary" klubo narys.

Nuo 2014 m. jis yra Lietuvos liberalų sąjūdžio narys. Lietuvos liberalų sąjūdis iškėlė V. Trinkūno kandidatūrą 2015 m. pirmuosiuose tiesioginiuose Druskininkų savivaldybės mero rinkimuose, bet jis nebuvo išrinktas.

2015 m. kaip Lietuvos liberalų sąjūdžio atstovas jis dalyvavo Druskininkų savivaldybės 2015–2019 m. kadencijos tarybos rinkimuose ir buvo išrinktas Tarybos nariu. Jis buvo opozicinės Mišrios frakcijos narys, kol 2017 m. sausį atsisakė Tarybos nario mandato.

Jaunystėje V. Trinkūnas aktyviai sportavo, buvo sportininkas rankininkas. 1973–1982 m. jis buvo Lietuvos rankinio jaunimo rinktinės, Kauno "Granito" ir Lietuvos vyrų rankinio rinktinės narys, SSRS čempionatų ir Tautų spartakiadų prizininkas.

V. Trinkūnui buvo suteiktas SSRS sporto meistro vardas. Druskininkų savivaldybė jam suteikė Metų verslininko titulą (2006 m.), jis gavo "Metų Boso" apdovanojimą Pietų Lietuvos regione (2012 m.). Lietuvos pramonininkų konfederacija jam suteikė "Profesijos riterio" titulą (2014 m.).

Laisvalaikiu sportuoja, medžioja.

Vedęs, žmona Dalė Trinkūnienė. Dukterys: Dovilė Trinkūnaitė (g. 1981 m.), Ieva Trinkūnaitė (g. 1987 m.) – verslininkė.