1972–1983 m. baigė Anykščių Antano Vienuolio vidurinę mokyklą. 1983–1988 m. studijavo Vilniaus universiteto Istorijos fakultete, įgijo žurnalistės išsilavinimą. 1990–1992 m. ji baigė Vilniaus universiteto Kalbų mokyklą.

1988 m. J. Miškinytė dirbo Vilniaus rajono laikraščio "Draugystė" redakcijoje  žurnaliste. 1988–1990 m. ji buvo Vilniaus universiteto Periodinės spaudos mokslinio tyrimo laboratorijos jaunesnioji mokslinė bendradarbė, 1989-1990 m. taip pat buvo Vilniaus rajono Rukainių rusų-lenkų vidurinės mokyklos lietuvių kalbos mokytoja.  

1990–1996 m. J. Miškinytė buvo savaitraščio "Kalba Vilnius" žurnalistė, 1996–1998 m. – šio savaitraščio atsakingoji sekretorė, 1998–1999 m. – vyriausioji redaktorė.

2001–2005 m. J. Miškinytė dirbo žurnalo "Ieva" redakcijoje žurnaliste. 2001–2002 m. ji taip pat buvo Tarptautinės reklamos asociacijos Lietuvos skyriaus atsakingoji sekretorė.

2004–2005 m. ji vedė Žinių radijo pokalbių laidą "Prieš srovę", bendradarbiavo ir žurnale "Žmonės". 2005–2006 m. buvo žurnalo "Istorijos" vyriausioji redaktorė, 2005–2007 m. – interneto portalo www.femina.lt kūrėja ir vyriausioji redaktorė, 2006–2007 m. – LTV2 laidos "Kuluarai" autorė ir vedėja.

2006–2009 m. J. Miškinytė-Šeštakauskienė dirbo žurnalo moterims "Lilit" redakcijoje, 2006 m. buvo vykdančioji redaktorė, 2007–2009 m. – vyriausioji redaktorė, kol šio žurnalo leidyba buvo nutraukta. 

Nuo 2009 m. ji yra interneto projekto www.gyva.net komandos narė.

2010–2014 m. J. Miškinytė dirbo Kultūros paveldo departamento prie Lietuvos Respublikos kultūros ministerijos atstove ryšiams su visuomene.

Nuo 2014 m. ji yra komunikacijos konsultantė ir laisvai samdoma žurnalistė.

J. Miškinytė-Šeštakauskienė yra turizmo organizatorė, gidė, nuo 2024 m. – Krokuvos (Lenkija) Vavelio katedros licencijuota gidė.

Laisvalaikiu skaito, mėgsta kiną ir riedučių sportą, augina šunį.

Ištekėjusi, vyras Raimondas Šeštakauskas (g. 1957 m.) – žurnalistas, verslininkas, vadovas. Vaikai: Milda Šeštakauskaitė (g. 1993 m.), Andrius Šeštakauskas (g. 1994 m.), Paulius Šeštakauskas (g. 1998 m.).