1972–1983 m. baigė Anykščių Antano Vienuolio vidurinę mokyklą. 1983–1990 m. studijavo Kauno politechnikos institute, įgijo maisto pramonės inžinieriaus mechaniko išsilavinimą. Studijas pertraukė 1984–1986 m., atlikdamas privalomąją karinę tarnybą sovietinėje kariuomenėje. 

1991–1993 m. D. Rutkauskas dirbo valstybės įmonėje "Utenos gėrimai" mechaniku, 1993–1995 m. buvo akcinės bendrovės "Utenos gėrimai" skyriaus viršininkas.

1995–1999 m. jis dirbo uždarosios akcinės bendrovės "Coca-Cola Bottlers Lietuva" direktoriaus pavaduotoju.

1999–2008 m. D. Rutkauskas buvo akcinės bendrovės "Ragutis" (pakeitus pavadinimą – "Volfas Engelman") prekybos ir marketingo direktorius. 2004–2008 m. jis taip pat buvo šios bendrovės valdybos narys.

2005–2007 m. jis studijavo Kauno technologijos universitete, įgijo tarptautinio verslo ir vadybos magistro išsilavinimą. 

2008–2021 m. jis dirbo akcinėje bendrovėje "Vilniaus degtinė", 2008–2010 m. buvo prekybos direktorius, 2010–2011 m. – eksporto direktorius, nuo 2011 m. – vėl prekybos direktorius, pardavimų ir pirkimų vadovas. Nuo 2009 m. jis buvo bendrovės "Vilniaus degtinė" valdybos narys.

Nuo 2021 m. D. Rutkauskas dirba uždarojoje akcinėje bendrovėje "Funkciniai gėrimai" (nealkoholinių gėrimų gamyba ir prekyba), yra pardavimų direktorius.

Nuo 2023 m. sausio jis taip pat yra uždarosios akcinės bendrovės "Toskanas" (maisto produktų ir alkoholinių gėrimų prekyba) komercijos direktorius.

D. Rutkauskas nuo 2021 m. yra Lietuvos žaliųjų partijos narys. 2023 m. kaip šios partijos sąrašo kandidatas jis dalyvavo Vilniaus miesto savivaldybės 2023–2027 m. kadencijos tarybos rinkimuose.

Lietuvos žaliųjų partijos sąraše ir kaip šios partijos kandidatas Deltuvos šiaurinėje rinkimų apygardoje Nr. 49 jis dalyvauja 2024 m. Lietuvos Respublikos Seimo rinkimuose.

D. Rutkauskas buvo Anykščių Antano Vienuolio gimnazijos Garbės galerijos narys (nuo 2006 m.).

Laisvalaikiu domisi sportu, mėgsta keliauti, klausytis klasikinės muzikos.

Buvo vedęs, žmona Rasa Dačiulytė-Rutkauskienė (g. 1965 m.) – pedagogė, sporto organizatorė, savivaldos organizatoriaus Algimanto Dačiulio (g. 1936 m.) duktė. Išsiskyrė. Dukterys: Simona Rutkauskaitė – vadybininkė ir Karolina Rutkauskaitė (g. 1990 m.).

Vėl vedė 2015 m. rugsėjį, žmona Brigita Rutkauskienė.