1961 m. baigė Traupio (Anykščių r.) vidurinę mokyklą. 1961–1967 m. studijavo Kauno medicinos institute.

1967–1970 m. J. Pliugžmienė dirbo Dono (Pskovo sritis, Rusija) geležinkelio ligoninės gydytoja terapeute.

1970–1981 m. ji buvo Vilniaus klinikinės ligoninės gydytoja elektrofiziologė.

1970–1972 m. J. Pliugžmienė taip pat buvo Vilniaus universiteto Hospitalinės terapijos katedros klinikinė ordinatorė.

1981 m. Kauno medicinos institute ji apsigynė disertaciją "Latentinės dekompensacijos nustatymas ligoniams, sergantiems išemine širdies liga (introkardinės monometrijos duomenimis)", buvo medicinos mokslų kandidatė, 1993 m. nostrifikuota biomedicinos mokslų, medicinos daktarė.

Nuo 1981 m. iki pensijos J. Pliugžmienė dirbo Vilniaus miesto klinikinės ligoninės Klinikinės elektrofiziologijos skyriaus vedėja. Ji yra aukščiausios kvalifikacinės kategorijos gydytoja.

Vėliau J. Pliugžmienė dar dirbo Medicinos diagnostikos centre gydytoja klinikine fiziologe ir Antakalnio ligoninėje gydytoja.

J. Pliugžmienė yra mokslinio leidinio "Medicinos teorija ir praktika" redaktorių kolegijos narė.

Jai priklauso racionalizacinis pasiūlymas "Plaukiančio tipo mikrokateterinis spaudimų matavimas širdies ertmėse". J. Pliugžmienė paskelbė 17 publikacijų medicinos mokslo klausimais, 8 iš jų – užsienio šalių leidiniuose.

Laiavalaikį skiria sportui – automobilių vairavimui, skaito grožinę literatūrą.

Ištekėjusi, vyras Jonas Vilgelmas Pliugžma – teisininkas, advokatas. Sūnus Giedrius Pliugžma (g. 1974 m.) – gydytojas terapeutas echoskopuotojas.