1990 m. baigė Svėdasų (Anykščių r.) vidurinę mokyklą. 1990–1996 m. studijavo Vilniaus universiteto Gamtos mokslų fakultete, įgijo geologo išsilavinimą.

Nuo 1998 m. iki šiol A. Čečys dirba Vilniaus universiteto Gamtos mokslų fakultete, yra Geologijos ir mineralogijos katedros mokslo darbuotojas, lektorius, dėsto struktūrinės geologijos kursą.

1998–2004 m. jis studijavo Lundo (Švedija) universiteto doktorantūroje.

2004 m. Lundo universitete apsigynė disertaciją "1,45 milijardų metų granitoidinio magnetizmo tektorinė įtaka Rytų Europos Kratono pietvakariniame pakraštyje", yra fizinių mokslų, geologijos daktaras.

Nuo 2004 m. jis buvo ir Lundo universiteto dėstytojas.

A. Čečys dirba Lietuvos geologijos tarnyboje prie Aplinkos ministerijos, yra Giluminių tyrimų skyriaus Regioninės geologijos ir tektonikos poskyrio vyriausiasis seismologas.

Jis yra Svėdasų J. Tumo-Vaižganto gimnazijos garbės galerijos narys (nuo 2007 m.).

Laisvalaikį skiria kelionėms, yra Vilniaus vandens turizmo sporto klubo "Vikingai" narys.

Vedęs.