1990 m. baigė Svėdasų (Anykščių r.) vidurinę mokyklą. 1990–1998 m. studijavo Vilniaus universiteto Gamtos mokslų fakultete, įgijo geologo išsilavinimą.

Studijų metais A. Čečys 1994–1997 m. dalyvavo tarptautiniame seisminiame projekte "EUROBRIDGE" ir vykdė lauko darbus Lietuvoje, Baltarusijoje ir Ukrainoje. Pusei metų pagal apsikeitimo programą jis buvo išvykęs į Lundo universitetą (Švedija).

1998–2004 m. jis studijavo Lundo (Švedija) universiteto doktorantūroje. Jis atliko petrologinius ir struktūrinius granitų tyrimus Pietų Švedijoje, Bornholmo saloje bei Vakarų Lietuvoje, kuriais remiantis buvo išskirta nauja orogenija.

2004 m. Lundo universitete jis parengė apsigynė disertaciją "1,45 milijardų metų granitoidinio magnetizmo tektorinė įtaka Rytų Europos Kratono pietvakariniame pakraštyje", yra fizinių mokslų, geologijos daktaras.

2004–2006 m. jis buvo Lundo universiteto dėstytojas.

Nuo 2006 m. iki šiol A. Čečys dirba Vilniaus universitete dėstytoju. Jis buvo Gamtos mokslų fakulteto Geologijos ir mineralogijos katedros mokslo darbuotojas, lektorius, dėstė struktūrinės geologijos kursą. Po institucijų pertvarkos jis yra Chemijos ir geomokslų fakulteto Geomokslų instituto asistentas, dėsto struktūrinės geologijos, geologinio kartografavimo ir kitus kursus.

2007–2008 m. jis atliko podoktorantūrinę stažuotę Chemijos institute ir, bendradarbiaudamas su Potsdamo (Vokietija) geotyrimų centro mokslininkais, tyrinėjo čarnokitus iš Vakarų Lietuvos.

Jis paskelbė mokslinių straipsnių tarptautiniuose mokslo leidiniuose, dalyvavo keliolikoje mokslinių konferencijų, yra užsienio lietuvių mokslininkų forumo narys.

A. Čečys yra Geologijos sąjungos narys ir tarybos narys, Geografų draugijos narys ir valdybos narys.

Jis dalyvavo socialiniame projekte "Drąsinkime ateitį", yra Svėdasų J. Tumo-Vaižganto gimnazijos garbės galerijos narys (nuo 2007 m.).

Laisvalaikį skiria kelionėms, yra Vilniaus vandens turizmo sporto klubo "Vikingai" narys ir valdybos narys.

Vedęs.